江苏省中医院脑病中心（神经内科）是省内最大的脑病中西医结合治疗中心，是江苏省卫健委的省级卒中中心建设单位，中国卒中联盟卒中中心，江苏省中医药局重点专科，国家药物临床研究基地神经内科专业科室，南京中医药大学神经病学硕士、博士研究生培养点。目前拥有4个病区，床位数152张，设有重症监护病床（NICU）8张。脑病中心现有医生46名，正高级专家25名，副高级专家8名，博士生导师4名，硕士生导师12名，具有博士学位者14名，硕士学位者27名，留学归国人员4人。脑病中心在学科带头人吴明华主任、姜亚军主任、顾锡镇主任带领下，开设中风、记忆障碍、睡眠障碍、心境障碍、帕金森病、眩晕、头痛、肌无力、癫痫等专病门诊，年门诊量超过15万余人次，年收治住院病人逾4500人次，制定了脑梗死、眩晕、帕金森病等疾病诊疗常规，以脑血管病（脑梗死、脑出血、脑动脉硬化等）、神经变性病（痴呆、帕金森病、运动神经元病等）和失眠为主攻方向，病种涵盖所有神经系统疾病和神经心理疾病。常规开展动静脉溶栓、脑血管造影和动脉支架植入等技术，于2002年8月成功完成江苏省首例颅内支架植入术（治疗缺血性脑血管病），神经介入诊疗技术省内领先，造福广大患者，获得了较好社会效益。
    脑病中心承担了“国家自然科学基金”、“省自然科学基金”、省中管局、省科技厅、省社科委多项课题，获厅局级以上科研成果3项、市级以上科技奖3项，研发新药2个，发表学术论文600余篇，其中SCI收录最高影响因子14分（Neuron），编写专著和教材50余部，培养南京中医药大学专科硕士研究生200余名。
    脑病中心坚持“突出中医特色、中西医结合为主、一切为了病人”的理念，强化专科特色，研制了“椎管宁”、“定痫丸”、“珍枣胶囊”“首乌合剂”等疗效突出的专科院内制剂。 “一流的技术，一流的医疗质量，一流的环境，一流的服务”永远是江苏省中医院脑病中心的广大医护人员的宗旨。脑病中心永远是广大神经系统疾病患者理想的治疗和康复基地。