江苏省中医院紫东院区位于南京市栖霞区仙林大道200号，由江苏省中医院和栖霞区人民政府、仙林大学城管委会三方合作建设，于2022年2月22日全面投入使用。 紫东院区一期占地面积约68.25亩，项目总建筑面积约15万平方米，总床位800张。结合总院一体化、同质化要求，整合国家、省级重点专科，一期重点打造“一院三中心”——名医堂中医高级诊疗、中西医结合肿瘤、急危重症、妇产生殖等多学科联合（MDT）诊疗中心。紫东院区开设门急诊、住院病房、医技检查等，科室均为省中总院科室的延伸，并增设产科；住院病区以总院优质医疗学科为主，注重人文护理关怀，构建先进的信息智能化系统，实现总院与院区的同步传递；发挥总院优质中医药学科专科和中医药人才特色优势，以“大专科、新综合”的发展模式，为群众提供全方位全生命周期的服务保障，努力打造中医行业的“梅奥”标杆。
紫东院区二期建设入选国家传承创新项目，将以临床为基础、科研为支撑、人才建设为集中呈现，建设包括研究型病房、生物资源信息样本库、中医药循证研究基地、多学科融合研究平台、古籍挖掘应用信息库和人才培养基地等。建成后，紫东二期将成为栖霞区、仙林大学城、南京市乃至江苏省“十四五”卫生事业发展的新亮点，全力打造“医产学研用”紧密结合的中医药传承创新高地。