科室先后承担国家级、省级科研项目20余项、厅局级科研项目50余项，其中，获得科技部、国家自然科学基金面上项目、国家自然科学基金项目青年基金、国家中医药管理局等国家级项目5项，获得江苏省科技厅(省科委)等省级项目20余项，获得江苏省中医药管理局等项目30余项，承担省级以上课题达10余项。

发表论文600余篇，其中，中文核心200余篇，SCI50余篇，高影响因子文章为14分（NEURON）、9.3分（Journal of Neuroinflammation）；取得国家专利4项；获得科学技术奖7项。2005年，于顾然、王永生、姜亚军主持的“机械再通加小剂量溶栓剂治疗急性大脑中动脉闭塞性脑卒中”项目获得江苏省医学新技术引进奖二等奖。2021年，李昀泽主持的“基于潜意识挖掘理论的视—听—嗅—触觉联动中医沙盘技术干预焦虑抑郁障碍患者的临床应用”项目获得江苏省医学新技术引进奖二等奖。2022年，吴明华主持的“协定方通脑饮促进血管生长改善急性脑梗死神经功能缺损的应用”项目获得江苏省医学新技术引进奖一等奖。2022年，于顾然主持的“阿尔茨海默‘病毒损脑络’生物模型构建及有效中药组分筛查”项目获得江苏省江苏中医药科学技术进步奖二等奖。