消化科在中医药治疗溃疡性结肠炎、慢性萎缩性胃炎及癌前病变、功能性胃肠病、肝胆疾病和消化道肿瘤等方面具有突出的优势，形成了稳定的研究方向，承担了国家科技部“十一五”支撑计划重大疑难疾病项目、国家自然科学基金、江苏省社会发展和自然科学基金等多项科研项目，合作参加了国家重点基础研究发展计划（973计划）、国家中医药管理局行业专项等多项重大课题。