科室重视基础研究，积极参与科学研究工作，成效显著，先后承担厅局级科研项目5项，其中获得江苏省中医药管理局项目5项。发表论文115篇，其中，中文核心71篇，SCI 15篇，中科院一区1篇，最高影响因子12.91；取得国家专利10项；获得科学技术奖2项。2008年，高觉民主持的“偶极子定位在癫痫诊疗中的作用”项目获得“江苏省卫生厅医学新技术引进奖 二等奖”；2019年，高觉民参与的“持续性植物状态（神呆）中医药辩治关键技术创建与应用”项目获得“中华中医药学会科学技术奖二等奖”。“偶极子定位技术在癫痫诊疗中的应用”荣获2008年江苏省卫生厅新技术引进奖二等奖。“葛根素防治蛛网膜下腔出血后脑血管痉挛的临床及实验研究”及“通腑泄浊法治疗脑出血术后脑水肿的研究”两项课题获得2009年江苏省中管局科研资助。同时承担多项院级、校级课题，以及其他资金来源的课题。发表论文数十篇，参编相关专业著作十余部。