先后承担国家级、省级科研项目65项、厅局级科研项目36项，其中，获得科技部、国家自然科学基金面上项目、国家自然科学基金项目青年基金、国家中医药管理局等国家级项目42项，获得江苏省科技厅(省科委)等省级项目23项，获得江苏省中医药管理局等项目36项。

1985年，邹燕勤主持完成国家卫生部科技司重点项目“慢性肾功能不全辨证论治的临床规律和原理研究”；2006年，孙伟主持完成国家科技部“十一五”重大疑难疾病“慢性肾脏病临床证治优化方案的示范研究”。2007年，盛梅笑主持完成国家科技部“十一五”科技支撑计划“益肾清利法治疗原发性系膜增生性肾小球肾炎肾虚湿热证临床疗效评价研究及示范应用”。

发表论文900余篇，其中，中文核心100余篇，SCI92篇，中科院一区3篇，最高影响因子17.15；取得国家专利4项；获得科学技术奖27项。

2022年，Efficacy of combined Abelmoschus manihot and irbesartan for reduction of albuminuria in patients with type 2 diabetes and diabetic kidney disease: A multicenter randomized double～blind parallel controlled clinical trial发表于一线期刊Diabetes Care，影响因子17.15，被评为中华中医药学会“2022年度中医药十大学术进展”。

1999年，王钢主持的“肾炎灵颗粒剂提高慢性原发性肾小球疾病疗效的临床和实验研究”项目获得江苏省科学技术进步二等奖；2020年，孙伟主持的“慢性肾脏病‘肾虚湿瘀’核心病机创新研究与临床应用”项目获得江苏中医药科学技术一等奖；2021年，邹燕勤主持的“邹氏‘补益肾元法’治疗慢性肾脏病的临床应用与转化”项目获得中华中医药学会科技进步二等奖。

主编（译）学术专著41部，参加编写《中西医结合内科学》教材。

1981年，邹云翔校订、邹燕勤整理的《邹云翔医案选》在江苏科技出版社出版；2003年，王钢、邹燕勤主编的《现代中医肾脏病学》在人民卫生出版社出版。