普内科是医院建立最早的科室之一，前身是1954年10月建院之初的中医内科。60多年来，从建院之初首任院长中国科学院学部委员叶橘泉，全国中医系统首批博士生导师，孟河医派代表邹云翔、张泽生等一代中医大家，到当代国医大师周仲瑛、徐景藩、邹燕勤等，一代代名医薪火相传，奠定了江苏省中医院普内科在全国的领先地位和学术影响力。

科室为江苏省中医药学会经典病房专业委员会主委单位，是江苏省首个中医经典科重点专科。现为“国医大师徐景藩学术经验传承研究室”、“全国名中医黄煌工作室”依托科室，是南京中医药大学中医内科学教学实习基地，国际经方学院临床基地，设有“经方传承研究室”、“经方教研室”、“中医内科学教研室”、“诊断学教研室”。

科室以陆为民教授为学科带头人，汇聚了一批名医专家和年富力强的技术骨干。现有副高职称以上专家14名，博士生导师5名，硕士生导师8名，国医大师学术传承人2名，全国名中医黄煌学术继承人3名。多名医师赴日本九州大学、美国弗吉尼亚大学、埃默里大学、美国缅因州东部医学（肿瘤）中心、英国皇家苏塞克斯医院、以色列施耐德医疗中心、香港浸会大学、台湾新光医院等研修及开展医学研究。

科室以慢性萎缩性胃炎、慢性结肠炎、糖尿病等作为重点研究病种，制定了以徐景藩学术经验及黄煌经方理论、中药内服与外治相结合的特色鲜明的诊疗方案，形成了健脾逆萎方、疏肝和胃方、抑肝扶脾方、降脂消浊方、八味解郁汤、四味健步汤等一系列效方验方，疗效显著。

科室以“普惠百姓传中医，内外兼修承经典”为理念，积极营造经方的文化氛围，不断总结经方用药经验，创新经方用药途径，开展经方特色护理，构建经方诊疗体系，打造以经方为诊疗特色的经典病房。门诊现有12个诊室，设有“国医大师徐景藩学术经验传承应用门诊”、“经方特色门诊”、“经方教学门诊”、“中医内科学教学示范门诊”及“中医综合治疗室”，年门诊量29万人次以上，诊治疾病以中医内科病证为主，包括胃痛、泄泻、内科癌病、头痛、眩晕、水肿、咳嗽、喘证等，彰显中医药特色优势。尤其在脾虚（如慢性腹泻、溃疡性结肠炎等）、肾虚（如女性更年期综合征、骨质疏松等）等各类虚损、疲劳综合征、亚健康的治疗方面具有丰富的经验，在汗证（出汗异常）、失眠、产后肾虚的中医调治方面有鲜明特色。

主编《经方概论》、《经方方证》、《各科经方》、《中医内科诊疗思维》、《中医内科临证治要》等特色教材，并出版《徐景藩脾胃病临证经验集萃》、《慢性萎缩性胃炎中医特色疗法》、《肺癌治疗与调养》、《冠心病自然疗法》等著作20余部，近5年发表论文200余篇，其中SCI论文30余篇。

科室围绕临床常见病展开了一系列中医经典临床及基础研究工作，先后承担国家科技攻关项目、国家自然基金课题、国家中医药管理局、江苏省科技厅社会发展及省卫健委、省中医药局、南京市科委等各级科研课题20余项，获江苏省科学进步奖3项，江苏省中医药科技进步二、三等奖各1项，获国家发明专利5项。